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比较糖蛋白质组学鉴定

日期:2020-10-20 18:40
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摘要:为了克服这个域存在的技术限制,在项新的研究中,奥地利科学院分子生物技术研究所(IMBA)主任Josef Penninger博士及其团队开发出质谱法和算法,终能够对复杂的糖结构进行综合识别,并且将它们绘制到相应糖蛋白的正确位点上。他们新开发的比较糖蛋白质组学(comparative glycoproteomics)平台于2017年9月20月在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity”。论文第编辑为IMBA研究员Jasmin Taubenschmid博士和IMBA蛋白质组研究员Johannes Stadlmann。他们的...
为了克服这个域存在的技术限制,在项新的研究中,奥地利科学院分子生物技术研究所(IMBA)主任Josef Penninger博士及其团队开发出质谱法和算法,终能够对复杂的糖结构进行综合识别,并且将它们绘制到相应糖蛋白的正确位点上。他们新开发的比较糖蛋白质组学(comparative glycoproteomics)平台于2017年9月20月在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity”。论文第编辑为IMBA研究员Jasmin Taubenschmid博士和IMBA蛋白质组研究员Johannes Stadlmann。他们的方法被称作为SugarQb(Sugar Quantitative Biology),能够获得对生物系统中的蛋白糖基化和聚糖修饰的全局性认识。他们将这种平台应用于两项概念验证研究---对胚胎干细胞糖蛋白质组进行分析和鉴定出毒性产生所必需的糖蛋白---中。

利用这种新的SugarQb方法,这些研究人员次绘制出小鼠和人胚胎干细胞糖蛋白质组草图。他们的研究结果几乎将所有已知的糖蛋白的数量增加了倍。他们也揭示出多种新的糖基化蛋白,这些糖基化蛋白包括进化上保守的糖修饰,以及小鼠和人干细胞多能性因子中的物种特异性糖修饰。他们发现的很多这样的糖基化蛋白位于细胞膜上,而且参与细胞间信号转导、细胞相互作用和胚胎发育。

SugarQb方法可以免费给所有的科学们。Stadlmann说,“大家希翼大家的平台将让各地的研究团队通过识别糖结构和它们在相应蛋白上的位置来开拓这个未知的域。” Penninger补充道,“糖基化在包括癌症在内中发挥着重要的作用。SugarQb方法将让科学们揭示新的生物学机制。它可能也被临床医师用来确定异常的糖蛋白质组特征为生物标志物和追踪作出的反应。

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